Η προσφυγή στο Συμβούλιο της Επικρατείας κρίθηκε επιβεβλημένη καθώς το υπουργείο Υποδομών δεν έλαβε υπόψιν του τις παρατηρήσεις που έθετε η απόφαση του Περιφερειακού Συμβουλίου Κρήτης επί της ΜΠΕ του έργου στην οποία είχαν συμπεριληφθεί οι ενστάσεις του Δήμου Μαλεβιζίου