Το έργο του καθηγητή Ζοπουνίδη αποτελείται από 500 εργασίες σε διεθνούς επιπέδου επιστημονικά περιοδικά, 120 βιβλία και 40 ειδικά τεύχη σε έγκυρα επιστημονικά περιοδικά